監(jiān)測人員應根據(jù)具體情況確定挑選出對解決問題最關鍵的指標，這樣不僅能較快的解決實際問題，而且能更合理地使用人力和經(jīng)費。在選擇監(jiān)測指標時，一般應遵循以下原則。

1．根據(jù)監(jiān)測目的的選擇監(jiān)測指標

例如，若要及時發(fā)現(xiàn)早期污染，可選擇對低濃度污染物敏感的動物行為反應或植物傷斑等易于觀測的指標。若要監(jiān)測環(huán)境污染程度，可采用植物化學分析方法直接測定監(jiān)測植物體內(nèi)污染物的蓄積量。防空核生化控制中心的使用場景人防BK-RF055分析樹木年輪性狀可揭示當?shù)匚廴練v史等等。

2．根據(jù)污染物的性質(zhì)和毒理作用機制選擇監(jiān)測指標

不同性質(zhì)的污染物其毒理作用機制不同，會產(chǎn)生不同的毒性效應。例如，有些污染物能抑制光合作用，或抑制呼吸作用。選擇光合效率或呼吸速率作為監(jiān)測指標就能達到監(jiān)測這些污染物的目的。防空核生化控制中心的使用場景人防BK-RF055又如，有些污染物能刺激超氧化物岐化酶、過氧化氫酶及過氧化物酶活性，這些酶的活性就是有用的監(jiān)測指標。

3．根據(jù)生物的特性選擇監(jiān)測指標

監(jiān)測生物可以是動物、植物或微生物；在結構上可以是單細胞的或多細胞的；在繁殖習性上可以是有性生殖或無性繁殖；在生態(tài)系統(tǒng)中所承擔的功能可以是生產(chǎn)者、消費者或分解者。這些差別都應在選擇監(jiān)測指標時予以考慮。例如，可以選用動物監(jiān)測具有神經(jīng)毒性作用的污染物。又如，可用蚯蚓吞食土壤腐敗有機質(zhì)的習性監(jiān)測土壤金屬污染，等等。